События разворачиваются в бескрайнем космическом пространстве, вместилище масштабных сражений и межзвездных путешествий. Главный герой по имени Харлок выступает в роли космического пирата, командующего одноименным линкором. Неизвестные обстоятельства выбрасывают корабль в эпицентр опасных приключений среди звезд. Судьба Харлока теперь напрямую зависит от исхода столкновений и маневров огромного боевого судна.