Япония 1883 года, спустя пять лет после поражения Макото Сишио. Бывший убийца Химура Кеншин уже обрел семью и привык к мирному существованию, однако обстоятельства вновь заставляют его взять в руки меч. Несмотря на подорванное здоровье, герой вместе со старыми товарищами отправляется на север острова Хоккайдо. Путешествие через новые земли становится поиском пропавшего тестя, который связывает прошлое и настоящее героев. Теперь бывшему мечнику предстоит выяснить правду и защитить близких в условиях новой эпохи.