В недалеком будущем большая часть человеческой цивилизации ушла под воду из-за резкого подъема уровня моря. Юноша Икару Нандзиме, потерявший мать и ногу в аварии, возвращается в родной город, наполовину поглощенный океаном. Вместе со сборщицей долгов Кэтрин он исследует затопленные руины лаборатории своей бабушки в поисках легендарного клада. Среди обломков они находят Атри — девушку-робота, чьи эмоции неотличимы от человеческих. В благодарность за спасение Атри обещает стать опорой для Икару и помочь выполнить последнее поручение его бабушки. Героям предстоит провести незабываемое лето в городке, медленно исчезающем в морской пучине.